Cette formation introduira les paquetages Bioconductor permettant l'analyse de données issues du séquençage nouvelle génération.

• Rappels des concepts du séquençage NGS
• Les outils d'annotation et de conversion d'identifiants
• L'analyse des reads et du résultat d'alignement
• L'analyse d'expression différentielle en RNA-seq
• Les techniques d'enrichissement
• Les outils de visualisation pour les NGS

La fin du stage (2 h) sera consacrée à un atelier pédagogique d'analyse et de réflexion sur les données apportées par les stagiaires.